原则同意你院第一种意见，即行政机关征用农村集体土地之后，被征用土地上的原农村居民对房屋仍享有所有权，房屋所在地已被纳入城市规划区的，应当参照《城市房屋拆迁管理条例》及有关规定，对房屋所有权人予以补偿安置。

　　附：《最高人民法院行政审判庭关于农村集体土地征用后地上房屋拆迁补偿有关问题的答复》【失效】(2005.10.12)